انبثقت فكرة إنشاء مجلس الطلبة تماشياً مع المستجدات التي تمر بها دول الخليج العربي ضمن انفتاحها على الحياة العصرية التي تعطي الحق للطالب أن يبدي رأيه وصوته من أجل حياة دراسية أفضل علمياً وعملياً.

ومن هنا جاء القرار بالموافقة على ضرورة اتخاذ الخطوات المطلوبة لتحقيق المجلس المنشود على أن يكون حلقة الوصل بين رئاسة الجامعة وادارتها وأبنائها الطلبة.

و قد حددت المادة 4 من الباب الثاني في اللائحة التنظيمية للمجلس الأهداف التي من أجلها يعمل المجلس وهي:

• تنمية شخصية الطالب وطنياً و اجتماعياً و رياضياً و ثقافياً ضمن قيم الحضارة و التراث الخليجي و العربي و الإسلامي و توثيق الأواصر بين أبناء دول الخليج العربية.
• تعزيز روح التعاون و مفهوم العمل الجماعي بين الطلاب و توثيق الروابط بينهم و بين الهيئتين الإدارية و الأكاديمية بالجامعة.
• تنمية الروح القيادية بين الطلبة و إتاحة الفرصة لهم للتعبير المسئول عن آرائهم.
• إبداء الرأي بخصوص مختلف القرارات التي تصدرها الجامعة سواء تلك التي تتعلق بالطلبة و الشئون الأكاديمية أو الإدارية و حتى القرارات التي تتعلق بالخدمات التي توفرها الجامعة للطلبة.
• الإسهام في حل مشاكل الطلبة الأكاديمية و الاجتماعية و الأخلاقية بالتعاون مع الجهات المختصة بالجامعة.
• التعاون مع كلية الطب في تشجيع الطلبة المتفوقين والارتقاء بمستواهم وقدراتهم ومهاراتهم.
• دعم الأنشطة الطلابية في المجالات العلمية والثقافية والاجتماعية والرياضية.
• توعية الطلاب بحقوقهم و واجباتهم وفقاً للأنظمة الجامعية المعمول بها.
• المحافظة على منجزات الجامعة و المساهمة في رفعة شأنها.
• الحرص على إرساء النظام بما يتفق مع رسالة الجامعة و أهدافها.

ويتشكل المجلس حالياً من 4 لجان وهي:

1. اللجنة الثقافية والإعلامية.
2. اللجنة الرياضية.
3. اللجنة العلمية.
4. لجنة الخدمات.